Jakie są dwa główne problemy związane z badaniem obecności patogenów w wodzie?

Nie można bezpośrednio zbadać obecności lub nieobecności patogenów w wodzie. Zamiast tego ocenia się wodę poprzez określenie obecności tzw. organizmów wskaźnikowych, które wskazują na potencjalne zanieczyszczenie.

Wykorzystywanie organizmów wskaźnikowych do oceny jakości wody wiąże się z dwiema trudnościami. Po pierwsze, brak organizmów wskaźnikowych niekoniecznie oznacza brak patogenów. Może się to zdarzyć, jeśli występuje pewna liczba patogenów, które nie są wykrywane przez organizmy wskaźnikowe, lub jeśli organizmy wskaźnikowe nie są obecne w momencie pobierania próbek. Po drugie, obecność organizmów wskaźnikowych niekoniecznie wskazuje na obecność patogenów. Może się to zdarzyć, jeśli organizmy wskaźnikowe nie są bezpośrednio związane z danym patogenem lub jeśli organizmy wskaźnikowe są bardziej odporne na warunki środowiskowe niż dany patogen.