Protokoły stosowane w QSAR

QSAR oznacza związek ilościowy działalności struktura . Używane pokazać jakstruktura chemiczna może być ilościowo skorelowany z określonym procesie QSAR często stosowane do projektowania leków i leków. Metodologia ta jest wykorzystywana do prowadzenia syntezy chemicznej , jak istnieje wiele tysięcy różnych możliwych struktur dla jednej cząsteczki i naukowców mogłyby tracić czas testowania każdą strukturę . Statystyki odgrywają ważną rolę w metodologii QSAR . Wielokrotny regresji liniowej

Analiza regresji wielokrotnej jest stosowany, gdy istnieje kilka badania stosowane , które są związane z jednej konkretnej struktury chemicznej . Równanie to rozwinięte, że , na przykład, może wykazywać zależność pomiędzy zmniejszenie wielkości guza oraz obecność grupy hydrofobowej na czwartej pozycji pierścienia fenylowego. Analiza ta zmniejsza wiele różnych związków , takkorelacja może być interpretowany przy użyciu tylkokilka parametrów , które sąnajważniejsze.
Pattern Recognition

Rozpoznawanie wzorców służy do określenia parametrów że wynik , gdy określone struktury chemiczne są zgrupowane . Istnieje kilka różnych rodzajów analizy rozpoznawania obrazów , takich jak Analiza głównych składowych , komputer zautomatyzowany ocenę struktury i automatyczną analizę danych za pomocą technik rozpoznawania wzorców . Statystyki rozpoznawania wzorców użyć oryginalnych danych i skorelowanie różnych struktur z wynikami biologicznych opartych na różnych wymiarach , z których najważniejszym było w pierwszym analizowanym składnikiem. Imperium porównawcza Analiza molekularna Pole

wersja QSAR wykonuje częściową analizę najmniejszych kwadratów sparowany z krzyżem walidacji do tworzenia prognoz dla aktywności biologicznej . W tego typu metody ,naukowiec przypisuje szczególne przepisy dotyczące dostosowania struktury molekularnej . Każda z cząsteczek nadaje się do siatki, a następnie różne interakcje są obliczane na podstawie oddziaływania z atomem sondy do różnych sieci . Istnieje wiele różnych równań , które mogą wynikać . W przeciwieństwie do innych typów regresji , to produkuje równań w których jest znacznie więcej parametrów niż możliwych związków
Apex - . 3D

Apex - 3D wykorzystuje system, który automatycznie wybiera najlepsze wyrównanie i potwierdzenie dla struktur w oparciu o potrzebne odpowiedzi biologicznej z poprzednich doświadczeniach. Jest to możliwe do wykrycia wpływu różnej orientacji wiązania , aktywności antagonistycznej w stosunku aktywności agonistycznej i wpływu różnych receptorów. To generuje 2D i 3D topograficzne matryce i może generować informacje dla par cząsteczek , a nie pojedynczych cząsteczek .
Zbliżanie genetyczne Funkcja

funkcja genetyczna przybliżenie jest stosowane, gdy istnieje kilka próbki i wiele różnych zmiennych badana , a gdy zbiory danych nie mają relacji liniowych . Wykorzystuje modele najlepiej oceniane najgorzej oceniane i modele obliczone na podstawie danych surowych . Opiera się ona coraz lepszych modeli jakości , zastępując najgorzej ocenione modele . Wiele różnych wiele pasowania są następnie dostarczane do naukowca , który następnie wybiera się ostateczny modelu. Podobieństwa między modelami są badane w celu dostarczenia informacji na temat korelacji strukturalnych i biologicznych . Imperium